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基因芯片技术服务 lncRNA芯片 超级增强子lncRNA芯片 环状RNA芯片 LncPath芯片 microRNA 芯片 全基因表达谱芯片 T-UCR芯片 piRNA芯片 |
NGS测序技术服务 RNA测序 tRNA测序 tRF&tiRNA测序 microRNA测序 RNA m6A甲基化测序 |
PCR芯片技术服务 nrStar™ ncRNA PCR芯片 NuRNA™ mRNA PCR芯片 miRStar™ miRNA PCR芯片 SAB功能分类PCR芯片 |
PCR技术服务 LncRNA实时定量PCR 环状RNA实时定量PCR microRNA实时定量PCR tRF&tiRNA实时定量PCR mRNA实时定量PCR |
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LC-MS tRNA修饰检测服务 |
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基因芯片技术服务 DNA甲基化芯片 DNA羟甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS测序技术服务 DNA甲基化测序 DNA羟甲基化测序 染色质免疫共沉淀测序 |
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蛋白相对定量 TMT标记定量技术 非标定量技术 |
蛋白修饰 TMT标记定量磷酸化 非标定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰，同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6A RNA出现在多种重要的细胞生命过程中，意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程，如干细胞分化、生物节律等，同时也参与了多种疾病的发生，包括肿瘤、肥胖和不育等。
图1：m6A甲基化和去甲基化示意图
目前对m6A的转录组研究方法为MeRIP-seq（mRNA甲基化测序）的方法，其原理是通过m6A特异性抗体对细胞内具有m6A修饰的RNA片段进行免疫共沉淀，将富集下来的RNA片段进行高通量测序。结合生物信息学分析，即可在转录组范围内对m6A修饰进行系统研究。
●灵活度高：能够直接对任意物种的转录组高甲基化片段进行测序，无需已知的基因组序列信息。
●检测范围广：覆盖整个转录组范围的甲基化区域。
●精确度高：能够在实际结合位点100-200个碱基范围内精确定位。
●数字化信号：直接对甲基化片段进行定量和测序，不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。
图2：MeRIP-seq实验流程图
1.m6A甲基化峰分析
表1：m6A甲基化谱数据列表
2.m6A甲基化峰注释
利用最新的RefSeq数据库，对peak所在位置进行注释，统计不同转录本区域出现peaks的次数。
图3：m6A甲基化峰分布图
3. m6A甲基化峰的可视化
m6A甲基化测序结果中的wig文件能够上传到基因组浏览器中，以便进行m6A信号区域的可视化。
