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基因芯片技术服务 DNA甲基化芯片 DNA羟甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS测序技术服务 DNA甲基化测序 DNA羟甲基化测序 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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蛋白相对定量 TMT标记定量技术 非标定量技术 |
蛋白修饰 TMT标记定量磷酸化 非标定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
Aksomics（原康成生物）的质谱检测平台能够为客户提供全面而准确的tRNA修饰谱。利用Agilent质谱仪，检测36种修饰碱基在各个样品中的修饰丰度。
服务特色：
● 优化的前期处理与Agilent优质设备
● 全面而准确的碱基修饰分析
分析流程：
图释：LC-MS tRNA修饰检测服务流程图。
| Number | Nucleoside | Symbol | Number | Nucleoside | Symbol |
|---|---|---|---|---|---|
| 01 | 3′-O-methyladenosine | 3′-OMeA | 19 | 1-methylguanosine | m1G |
| 02 | 2′-O-methylcytidine | Cm | 20 | 7-methylguanosine | m7G |
| 03 | 5-methylcytidine | m5C | 21 | N2-methylguanosine | m2G |
| 04 | N6-isopentenyladenosine | i6A | 22 | 3′-O-methylinosine | 3′-OMeI |
| 05 | 5,2′-O-dimethylcytidine | m5Cm | 23 | 2-thiouridine | s2U |
| 06 | 1-methyladenosine | m1A | 24 | 4-thiouridine | s4U |
| 07 | 2-thiocytidine | s2C | 25 | 5-methyluridine | m5U |
| 08 | N2,N2,7-trimethylguanosine | m2,2,7G | 26 | N4-acetylcytidine | ac4C |
| 09 | N4-acetyl-2′-O-methylcytidine | ac4Cm | 27 | 3′-O-methyluridine | 3′-OMeU |
| 10 | N6-methyladenosine | m6A | 28 | 5-methyl-2-thiouridine | m5s2U |
| 11 | 3-methylcytidine | m3C | 29 | 5-methoxyuridine | mo5U |
| 12 | 3′-O-methylcytidine | 3′-OMeC | 30 | pseudouridine | Ψ |
| 13 | 2′-O-methyladenosine | Am | 31 | 2′-O-methylinosine | Im |
| 14 | N2,N2-dimethylguanosine | m22G | 32 | 3-methyluridine | m3U |
| 15 | 5′-O-methylthymidine | 5′-OMeT | 33 | 3′-O-methylguanosine | 3′-OMeG |
| 16 | 2′-O-methyluridine | Um | 34 | 1-methylpseudouridine | m1Ψ |
| 17 | inosine | I | 35 | 5-hydroxymethylcytidine | hm5C |
| 18 | 2′-O-methylguanosine | Gm | 36 | 5,2′-O-dimethyluridine | m5Um |
1. 修饰定量分析
图释：tRNA修饰数量分析图。
2. 总离子流程图
图释：总离子流程图
3. 不同离子对合并Peak图
优化的前期处理与Agilent优质设备，确保了各修饰碱基之间具有很好的区分度。
图释：不同离子对合并Peak图。
4. 差异性tRNA修饰
对不同样本间的修饰丰度进行比较分析，发现具有差异修饰的核苷酸。这些修饰的差异可能导致tRNA在合成、稳定性以及功能发挥等方面明显的差异。
图释：tRNA修饰Heatmap图。
