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基因芯片技术服务 m6A单碱基分辨率芯片 mRNA&lncRNA表观转录组芯片 circRNA表观转录组芯片 |
NGS测序技术服务 RNA m6A甲基化测序（MeRIP Seq） |
LC-MS mRNA碱基修饰检测 tRNA碱基修饰检测 |
PCR技术服务 m6A绝对定量RT-PCR技术服务 m6A单碱基位点PCR（MazF酶切法）技术服务 |
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基因芯片技术服务 DNA甲基化芯片 DNA羟甲基化芯片 ChIP-chip |
NGS测序技术服务 DNA甲基化测序 DNA羟甲基化测序 染色质免疫共沉淀测序 |
PCR技术服务 MeDIP-qPCR hMeDIP-qPCR ChIP-qPCR |
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蛋白相对定量 TMT标记定量技术 非标定量技术 |
蛋白修饰 TMT标记定量磷酸化 非标定量磷酸化 |
RNA/蛋白-蛋白相互作用 RNA-蛋白相互作用 蛋白-蛋白相互作用 |
超级增强子lncRNA（SE-lncRNA）一般具有稳定性差、半衰期短的特点。它们能以极低的拷贝数发挥顺式作用，激活靶基因的表达。比如，SE-lncRNA HOTTIP可激活HOXA基因簇，其在细胞中的平均拷贝数少于1。
为了精确地检测这些瞬时、低水平的SE-lncRNA，Arraystar科学家开发了一套高效的线性扩增方法，能够为多聚腺苷化或非多聚腺苷化的转录本产生足量的荧光标记cRNA。在此过程中，将分别携带有T7聚合酶启动子序列的oligo(dT)和随机引物以最优比例混合，作为反转引物合成cDNA第一链，随后进行双链cDNA合成与PCR扩增。最后，由T7 RNA聚合酶进行体外转录，合成带有Cy3或Cy5标记的cRNA（下图）。
该标记方法极大的增加了低丰度或降解RNA分子的cRNA产物，比传统方法提高了100多倍。
图释：Arraystar公司SE-lncRNA芯片cRNA标记流程。(1) cDNA第一链合成与5’接头退火。 以携带有T7聚合酶启动子序列的oligo(dT)和随机引物混合物为反转引物，合成cDNA第一链，并与5’接头退火，合成cDNA第二链。(2) PCR扩增。使用RT引物和5’接头序列对双链cDNA进行低循环数的PCR扩增。(3)体外转录和标记反义RNA (aRNA)。以Cy3或Cy5标记的核苷酸为底物，双链cDNA为模板，使用T7 RNA聚合酶进行体外转录，合成带有荧光标记的反义RNA。线性扩增保留了原始转录本的相对水平和完整序列，且无3’偏好性。
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